Xiiiiiii......
Bug do Windows....
Se abrir um ZIP diretamente no navegador, e usar recortar/colar, acusa arquivos duplicados.
Se usar o copiar/colar, tudo bem.
Se primeiro baixar, tudo bem também.
Não sei em qual versão do Windows isso começou.
No momento estou usando Windows 10 PRO versão 1709 compilação 16299.19