Muito provavelmente, o problema é incompatibilidade de "locks", então talvez a solução esteja em descobrir qual incompatibilidade.
Questão, têm como confirmar que todos os seus arquivos .dbf foram criados pelo Harbour?
Têm muita gente que usa .dbf criado ainda pelo Clipper/Foxpro/Paradox e o coitado do Harbour, tem que manter tudo funcionando.
Pelo que sei, o Harbour não converte automaticamente os .dbfs.